По состоянию на 16 июня 2020 года Центром гигиены и эпидемиологии ЯНАО подтверждено 93 новых случая заболевания коронавирусной инфекцией с клиническими проявлениями. 
За весь период в ЯНАО подтверждено 3505 случаев COVID-19. Выздоровели от коронавируса 1559 человек. 
В целом 16 июня в населенных пунктах ЯНАО подтверждено 73 новых случая заболевания коронавирусной инфекцией. За все время – 1865 случаев, выздоровели 520 человек. Распределение по населенным пунктам:
Пангоды – 67, выздоровели – 44, новых - 1
Приозерный – 1, новых нет
Надым – 57, выздоровели – 7, новых - 5
Ягельный - 1
Салехард – 384, выздоровели – 207, новых - 3
Новый Уренгой – 988, выздоровели – 141, новых - 44
п. Уренгой – 7, выздоровели – 3, новых - 1
Ханымей – 29, выздоровели – 28, новых нет
Тарко-Сале – 38, выздоровели – 3, новых - 2
Пурпе – 9, выздоровел - 1, новых - 4
Пуровск – 2, новых нет
Харампур – 1, новых нет
Ноябрьск – 60, выздоровели – 24, новых - 4
Губкинский – 103, выздоровели – 17, новых - 2 
Лабытнанги – 10, новых нет
Аксарка – 18, выздоровели – 14, новых - 1
Харп – 26, выздоровели – 12, новых нет
Яр-Сале – 1, выздоровел – 1, новых нет 
Муравленко – 32, выздоровели – 11, новых - 5
Тазовский – 30, выздоровели – 6, новых нет
Красноселькуп – 1, выздоровел – 1, новых нет

В целом 16 июня на месторождениях и производственных объектах ЯНАО подтверждено 20 новых случаев клинических форм заболевания COVID-19. За весь период зарегистрировано 1640 случаев. Выздоровели – 1039. Территориальное распределение:
Пуровский район – 71, выздоровели – 41, новых - 1
Ямальский район – 482, выздоровели – 461, новых нет
Тазовский район – 17, выздоровели - 4, новых нет
Якутия (проходят лечение в Ноябрьске) – 21, выздоровели – 21, новых нет
Предприятия в районе Нового Уренгоя – 737, выздоровели – 269, новых - 18
Надымский район – 148, выздоровели – 115, новых нет
Салехард – 86, выздоровели – 86, новых нет
Предприятия в районе Ноябрьска – 53, выздоровели – 33, новых - 1
Губкинский – 14, выздоровели – 9, новых нет
Лабытнанги – 11, новых нет

16 июня подтверждено 170 случаев бессимптомного носительства COVID-19 в ЯНАО. 153 случая – среди вахтовых рабочих, 17 – в населенных пунктах.